Уголовное дело в отношении Абубекярова находится в производстве следственной части при УВД по Омской области. Органами следствия Абубекяров обвиняется в вымогательстве, разбое, контрабанде и незаконном хранение оружия.
Следствием установлено, что в период с 2002 по 2007 гг. Абубекяров в составе преступной группы в Омской области занимался вымогательством под угрозой расправы. Так, у директора фермерского хозяйства Абубекяров ежегодно требовал половину урожая пшеницы. Общая сумма ущерба, нанесенного действиями Абубекярова, составила более 5 млн. рублей.
Кроме того, в октябре 2007 г. Абубекяров незаконно перевез через таможенную границу России партию сельхозтехники на сумму около 1 млн. руб.
В июле 2008 г. Абубекяров был объявлен в международный розыск, а в августе того же года он был арестован на территории Германии. В сентябре генпрокуратура направила в минюст страны запрос о его экстрадиции, который был удовлетворен в ноябре.