Как сообщили в Следственном комитете, в январе 2008 года Лебедев в рамках национального проекта «Развитие агропромышленного комплекса» получил в отделении Сберегательного банка России кредит в сумме 700 тысяч рублей на приобретение сельскохозяйственных животных, однако заемные деньги потратил не по целевому назначению. С целью незаконного получения государственной субсидии на возмещение затрат на уплату процентов по кредиту, он изготовил подложные документы, подтверждающие целевое использование кредитных денежных средств, и с заявлением о возмещении процентной ставки по кредиту предоставил в Министерство сельского хозяйства и продовольствия Омской области.
В 2009 году Лебедеву выплачено 42 тыс. руб. из средств федерального бюджета и бюджета Омской области.