Пресс-секретарь суда Юлия Соколенко сообщила «БК55», что суд объявил резулятивную часть решения, через пять дней буде изготовлено мотивировочное решение. На суде сам обвиняемый не присутствовал из-за тяжелого состояния здоровья. Его жена и адвокаты настаивали на полном оправдании. Прокуратура возражала.
В итоге суд решил заменить два с половиной года реального срока на условный. Так же ему один год запрещено занимать соответствующие должности.
Проректор вместе с начальником управления экономического развития университета Татьяной Филимоновой обвинялись в махинациях с бюджетными средствами, в результате которых было похищено свыше 3,3 млн. рублей. В феврале 2010 года приговором Центрального суда Филимонова осуждена за совершение данного преступления к 5 годам лишения свободы. В отношении Ширяева в связи с болезнью уголовное дело было выделено в отдельное производство. А в декабре суд признал Ширяева виновным и назначил ему наказание в виде 2 лет 6 месяцев лишения свободы в исправительной колонии общего режима.